- Oggetto:
- Oggetto:
BIOMEDICAL IMAGING
- Oggetto:
Biomedical Imaging
- Oggetto:
Academic year 2024/2025
- Course ID
- BIO0242 Pds 308-BIDD
- Teachers
- Walter Dastrù
Enza Di Gregorio
Giuseppe Ferrauto
Silvia Daniela Morbelli
Francesca Reineri - Degree course
- [0101M22] Molecular Biotechnology
- Year
- 1st year
- Teaching period
- Second semester
- Type
- Related or integrative
- Credits/Recognition
- 11
- Course disciplinary sector (SSD)
- SSD: CHIM/03 - general and inorganic chemistry
- Delivery
- Formal authority
- Language
- English
- Attendance
- Obligatory
- Type of examination
- Written and oral
- Prerequisites
- Basics of general chemistry (structure of molecules, Lewis theory of acid-base, aqueous solutions and chemical equilibria, supramolecular interactions).
Basis of physics and Chemical Physics, in particular knowledge about basis of electromagnetic waves, interaction light-matter and uv-vis spectroscopies. - Oggetto:
Sommario del corso
- Oggetto:
Course objectives
This course contributes to the educational objectives of the preparatory area of the master degree course in " Molecular Biotechnologies" with specific curriculum in "Biomedical imaging and drugs discovery". It is aimed at providing students with solid knowledge in the technologies for in vivo imaging and application of imaging probes for in vivo diagnostic, a core of this curriculum of the master degree. In particular, the course aims to provide students with:
- an introduction to interdisciplinary (chemical, biological, radiological) language and to the scientific methodologies related the imaging tecnologies and imaging probes.
- basis in the field of in-vivo imaging techniques, including knowledge about how the different methods works and the fundamental chemical-physical principles on which the different techniques are based.
- knowledge about imaging methods available at preclinical level (basic and translational research) and/or used in the clinical practice for the diagnosis of different pathologies. Attention will be also dedicated to more innovative methods that have not been translated into the clinical routine, but that are currently being investigated in clinical and pre-clinical studies. In particular MRI, x-ray TC, OI, US, PAI and nucleare medicine will be studied.
- an in-depth knowledge into the relationships between imaging probes (used at preclinical and clinical level) and biological systems (macromolecules, cells, living organisms).
The overarching goal of the course is giving to the students the fundamental knowledge for the comprehension of the main diagnostic in vivo imaging techniques. In particular, this module wil offer the basics and the main preclinical and clinical applications of Magnetic Resonance Imaging (MRI), Optical Imaging (OI), Ultrasound imaging (US), Photoacoustic Imaging (PAI), Positrone emission tomography (PET) and single photon emission computed tomography (SPECT).
Questo corso contribuisce agli obiettivi formativi dell'area propedeutica del corso di laurea magistrale in "Biotecnologie molecolari" con curriculum specifico in "Imaging biomedico e sviluppo di farmaci". È finalizzato a fornire agli studenti solide conoscenze sulle tecnologie per l'imaging in vivo e sull'applicazione di sonde di imaging per la diagnostica in vivo, partec essenziale di questo curriculum nell'ambito del corso di laurea magistrale. In particolare, questo insegnamento mira a fornire agli studenti:
- un'introduzione al linguaggio interdisciplinare (chimico, biologico, radiologico) e alle metodologie scientifiche relative alle tecnologie di imaging e alle sonde di imaging.
- basi nel campo delle tecniche di imaging in vivo, inclusa la conoscenza del funzionamento dei diversi metodi e dei principi chimico-fisici fondamentali su cui si basano le diverse tecniche.
- conoscenza dei metodi di imaging disponibili a livello preclinico (ricerca di base e traslazionale) e/o utilizzati nella pratica clinica per la diagnosi di diverse patologie. Attenzione sarà dedicata anche a metodi più innovativi che non sono stati tradotti nella routine clinica, ma che sono attualmente oggetto di studio in studi clinici e preclinici. In particolare saranno studiati MRI, X-ray TC, OI, US, PAI e medicina nucleare.
- una conoscenza approfondita delle relazioni tra sonde di imaging (utilizzate a livello preclinico e clinico) e sistemi biologici (macromolecole, cellule, organismi viventi).
L'obiettivo generale del corso è fornire agli studenti le conoscenze fondamentali per la comprensione delle principali tecniche di imaging diagnostico in vivo. In particolare, questo modulo offrirà le basi e le principali applicazioni precliniche e cliniche di Magnetic Resonance Imaging (MRI), Optical Imaging (OI), Ultrasound Imaging (US), Photoacoustic Imaging (PAI), Positrone emission tomography (PET) e single photon emission computed tomography (SPECT).
- Oggetto:
Results of learning outcomes
At the end of the course, the student should know:
- how the main MRI sequences work
- the main parameters of the sequences and should be able to modify these parameters in order improve MR images
- which different contrast agents can be used for MRI and their effect on images
- which information can be obtained about different pathologies, using MRI-MRS techniques.
- the main optical methodologies for in vivo imaging
- the properties of fluorescent proteins
- how to exploit energy transfer methodologies (FRET, BRET)
- the photo-physical properties of a fluorescent agent
- the features of Ultrasound imaging and the US contrast agents
- the chemico-physical basis of Photoacoustic effect and the application for generation of medical images
- which information can be obtained about different pathologies, using PAI
- the properties of both endogenous and exogenous PAI contrast agents
Knowledge and understanding
At the end of the course, the students will have a good knowledge of the different in-vivo imaging techniques, of their working principles and their respective strengths and weaknesses.
They will be able to identify which kind of information can be obtained from each method (anatomical, functional or metabolic information) and to evaluate which imaging technique can provide meaningful information about a specific disease.
Making judgement
The students will be able to discuss, in small groups and with the professor, about scientific publications concerning in-vivo imaging methods. Theys will also have the capability to interpret experimental results obtained using different imaging techniques.
Communication skills
The correct specific terminology used for the different imaging methods will be acquired.
The students will grow the appropriate knowledge to present scientific papers and results concerning the in-vivo imaging methods.
These skills will be developed though the active involvement of the students during class discussions.
Learning skills
The students will develop an autonomous learning and self assessment capacity, that will make them ready to start their future career with a high degree of independence.
Al termine dell'insegnamento lo studente dovrà conoscere:
- il funzionamento delle principali sequenze MRI
- i parametri di acquisizione delle sequenze e modificarli per migliorare la qualità delle immagini
- l'azione delle principali categorie di agenti di contrasto
- quali informazioni possono essere ricavate, mediante le tecniche MRI-MRS, riguardo diverse patologie
- le principali metodologie di imaging ottico in vivo
- le proprietà e l'uso delle proteine fluorescenti
- come utilizzare le metodologie di trasferimento di energia (FRET, BRET)
- le caratteristiche foto-fisiche di un agente fluorescente
- le caratteristiche dell'imaging a Ultrasuoni e degli agenti di contrasto per questa tecnica
- le basi chimico-fisiche dell'effetto fotoacustico e la sua applicazione nella generazione di immagini mediche
- quali informazioni sulle diverse patologie si possono ottenere applicando l'imaging fotoacustico
- le proprietà degli agenti di contrasto endogeni ed esogeni
Conoscenza e comprensione
Alla fine del corso, gli studenti avranno una buona conoscenza delle diverse tecniche di imaging in vivo, dei loro principi di funzionamento e dei rispettivi punti di forza e di debolezza.Saranno in grado di identificare quale tipo di informazioni possono essere ottenute da ciascun metodo (informazioni anatomiche, funzionali o metaboliche) e di valutare quale tecnica di imaging può fornire informazioni significative su una specifica malattia.
Capacità di Giudizio
Gli studenti saranno in grado di discutere, in piccoli gruppi e con il professore, sulle pubblicazioni scientifiche riguardanti i metodi di imaging in vivo. Saranno inoltre in grado di interpretare i risultati sperimentali ottenuti utilizzando diverse tecniche di imaging.
Abilità comunicative
Sarà acquisita la corretta terminologia specifica utilizzata per i diversi metodi di imaging.
Gli studenti acquisiranno le conoscenze appropriate per presentare articoli scientifici e risultati riguardanti i metodi di imaging in vivo.
Queste competenze saranno sviluppate attraverso il coinvolgimento attivo degli studenti durante le discussioni in classe.
Capacità di apprendimento
Gli studenti svilupperanno una capacità di apprendimento autonomo e di autovalutazione, che li renderà pronti ad iniziare la loro futura carriera con un alto grado di indipendenza.T).
- Oggetto:
Program
- Image construction using magnetic field gradients
- Different pulse sequences for MRI
- What is contrast in MRI and how can be enhanced (without contrast agents). repetition time (TR) and echo time (TE) parameters.
- Paramagnetic contrast agents (T1 and T2 CAs)
- CEST and smart contrast agents (pH responsive agents).
- In vivo Magnetic Resonance Spectroscopy of heteronuclei (13C-MRS, 31P-MRS, 19F-MRS)
- In vivo MRS for treatment response and detection of disease (13C hyperpolarized CAs)
- Diffusion MRI: a biomarker for early detection of treatment response in cancer disease
- Basics of optics and electromagnetic radiations
- Photoluminescence
- In vivo optical imaging methodologies
- Fluorescent proteins and Bioluminescence
- Exogenous fluorescent probes
- Basics of ultrasound
- Ultrasound imaging
- Contrast agents for Ultrasound imaging
- Physical basics of Photoacoustic effect
- PA imaging (PAI)
- PA contrast probes: endogenous and exogenous agents
- Basic concepts of clinical application of PET and SPECT imaging in medicine.
- Overview about technical aspects of PET and SPECT tomographs.
- Overview about a pre-clinical (laboratory) and clinical (hospital) facilities for nuclear medicine and molecular imaging.
- Synthesis and Production of PET radiopharmaceuticals using a Gallium-68 Generator
- Synthesis and Production of PET radiopharmaceuticals using a cyclotron facility
- Clinical and Pre-clinical application of nuclear medicine imaging in cancer, endocrinology, in Neurology and degenerative disorders, Cardiology
- Design and concept of Novel Radiopharmaceuticals: how does it work?
- Principi di formazione dell'immagine in MRI mediante gradienti di campo magnetico
- Sequenze di impulso
- Il contrasto nelle immagini MRI, come può essere variato (parametri TR e TE).
- Agenti di contrasto paramagnetici in MRI
- Agenti di contrasto CEST, agenti responsivi di pH
- Spettroscopia NMR in vivo: spettri di eteronuclei (13C, 19F, 31P)
- Spettroscopia NMR in vivo per il rilevamento precoce dell'efficienza di un trattamento terapeutico e per la diagnosi (agenti di contrasto iperpolarizzati)
- Diffusion MRI
- Principi base di ottica e radiazioni elettromagnetiche
- Fotoluminescenza
- Metodologie di imaging ottico in vivo
- Proteine fluorescenti e Bioluminescenza
- Sonde fluorescenti esogene
- Principi base degli ultrasuoni
- Imaging a ultrasuoni
- Agenti di contrasto per imaging a ultrasuoni
- Basi fisiche dell'effetto fotoacustico
- imaging fotoacustico (PAI)
- Agenti di contrasto endogeni ed esogeni in imaging fotoacustico
- Concetti di base dell'applicazione clinica dell'imaging PET e SPECT in medicina.
-Panoramica sugli aspetti tecnici dei tomografi PET e SPECT.
-Panoramica sulle strutture precliniche (laboratorio) e cliniche (ospedaliere) per la medicina nucleare e l'imaging molecolare.
-Sintesi e produzione di radiofarmaci PET utilizzando un generatore di gallio-68
-Sintesi e produzione di radiofarmaci PET utilizzando una struttura ciclotrone
-Applicazione clinica e preclinica dell'imaging di medicina nucleare in cancro, endocrinologia, in neurologia e disturbi degenerativi, cardiologia
-Progettazione di nuovi radiofarmaci: come funziona?
- Oggetto:
Course delivery
The Course will consist of lectures (22h) and practical classes (2h).
Il corso consiste in lezioni frontali (22h) e esercitazioni pratiche(2h)
- Oggetto:
Learning assessment methods
Knowledge acquisition will be assessed by either an oral or written examination in which students will be asked questions about the main topics of the course. The use of correct terminology and clarity of the exposition will be also evaluated.
In particular, three different exams will be delivered.
The first part will be an oral exam will be delivered by Prof. Reineri and Dr. Dastrù and it deals with NMR/MRI, including the resolution of simple exercises.
The second part of the exam will be about OI/US/PAI techniques. It includes multiple-choice and open questions (2/3 of the score) and the presentation of a scientific paper focused on the topics of the course (1/3 of the score) (prof. Ferrauto and Dr. Di Gregorio).
The third part is about the module of PET/SPECT (Prof. Morbelli).
The final score is the weighted mean of the three modules.
L'acquisizione delle conoscenze sarà valutata tramite un esame orale e scritto in cui agli studenti verranno poste domande sugli argomenti principali del corso. Verranno inoltre valutati l'uso di una terminologia corretta e la chiarezza dell'esposizione.
In particolare, per questo modulo saranno eseguiti tre esami distinti.
-La prima parte sarà un esame orale che sarà somministrato dal Prof. Reineri e dal Dott. Dastrù e riguarderà le tecniche NMR/MRI, inclusa la risoluzione di semplici esercizi.
-La seconda parte dell'esame riguarderà le tecniche OI/US/PAI. Include domande a risposta multipla e aperte (2/3 del punteggio) e la presentazione di un articolo scientifico incentrato sugli argomenti del corso (1/3 del punteggio).
-La terza parte sarà riguarderà il modulo di medicina nucleaare ( pRof. Morbelli).
Il punteggio finale sarà la media pesata dei tre moduli.
- Oggetto:
Support activities
During the course students can count on a teacher for support with any questions/problems, one afternoon a week, upon making an appointment.
Durante tutta la durata del corso gli studenti potranno contare sul supporto dei docenti per ogni domanda/problema, un pomeriggio alla settimana, previo appuntamento.
Suggested readings and bibliography
- Oggetto:
- Joseph P. Hornak website: http://www.cis.rit.edu/htbooks/mri/
- Hashemi. R.H.; Bradley, Jr. W.G.; Lisanti, C.J. MRI. The Basics.
- Weishaupt, D.; Köchli, V.D.; Marincek, B. How Does MRI Work?
- For Photoacoustic module reviews and links to didattic websites will be provided, in addition to slides
- Oggetto:
Notes
Students are required to register for the course both on campusnet (https://biotec.campusnet.unito.it) and on the Moodle (https://biotec.i-learn.unito.it) platform.
The didactic material will be present on both platforms.- Oggetto:
Teaching Modules
- MRI/OI/US/PAI (BIO0242B Pds 308-BIDD)
- PET/SPECT/CT (BIO0242A Pds 308-BIDD)
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- Oggetto: